GenSeed - Contig report
The sequences below represent the different contigs obtained in each one of
the assembly rounds. These contigs necessarily contain the seed(s) sequence(s)
when the seed was a nucleotide sequence. For protein seeds, the seed
sequence is only listed from the second round.
Round #1
>C_jejuni - extended sequence - Contig1
TGATATTGAGCTTGTGGCGATAAATGATACTACGGATATTGAACTTACAAAATACCTTTT
TAAATACGATACAGTACATGGTGAATTTAAAGGCAGTGTTGATAGTGAAGGAGATGATTT
AGTGGTAAATGGTAAAAAAATCAAAGTATTTAAAAGTCGCAATGTAAAAGATCTTGACTT
TGCAAAACACGGCGCACAAATTGTTTTAGAGTGCACAGGAGCGCATTTAACTATGGCAAA
ATGTCAAGAATTTATAGATATGGGAGTACAAAAAGTGATCATGAGTGCTCCTGCAAAAGA
TGATACTCCTACTTATGTTTTAGGAGTAAATTCAGAACTTTACAAGGGTGAAAGCATTAT
TTCTAATGCAAGTTGTACAACAAATTGTTTAGGTCCTGTTTGTCGTGTTTTACAAGATAA
TTTTGGCATAGAAAAAGGACTTATGACAACAATACATGCTTATACAAATGGACAAAGTAT
TATTGATGCTAAAGCTAAAGATAAACGCCGTTCTCGTGCTGCAGCGCAAAATATCATTCC
AACTTCTACAGGCGCAGCAAAAGCTATGAAACTTGTTATGCCTGAACTTAATGGCAAGCT
GCATGGACAAAGTATGCGTGTGCCAGTGATTGATGTATCAAGCGTGGATTTAACTGCACA
ACTAAGCCGCAAAGTTAGCAAAGATGAAATCAATGAAGCTTTCAGAAAAGCTGCAGCTAC
AAATTTAAAATGCATCTTAATGGTAGATGATGATG
Round #2
>C_jejuni - extended sequence - Contig1
ATTTGTATTTAAAGTGTCGCGTATGAAAGAAGAAGCGATTTTTTTATTGGTTTTTAAATC
TTTGAAATTCTTAGGAATTCCTATATCATTGCGAGGGGGAATAACAAATTCTACTAAAGA
ATTGAGTTTTTCAAAATCATGCCAAAGATGAAGTTTTTCTAAATGATCTGCGCCAATTAA
AAGATAAAATTTACTAGGATTATAAAGCTTATAAAGATACTTAACACTTTCTATGCTAGG
AACAGGGCGTTTTTGCCTGATTTCAAAATCGCAAATTTCAACTTTTGGCAAATGTCCCCA
AAGTTTTTTAACCCATAAGAATCTTTGCTTTTCATCAGCACTAAAACTTTGTTTAAAAGG
ATTGATATAAGTAGGCATAATAATAAGTTTATCAATATCTAATTTTTCCAAAGCCTCTAA
AACAACGCTATTATGACCATTATGCGGTGGATCAAAACTGCCACCAAAAAGTGCTATCTT
CATTAAAATTTTAACCTTTTTTTGTAGAATATTAGCATTATATTTTGCAAAAGGAAATTA
AATGGCTGTAAAAGTTGCTATAAATGGTTTTGGACGCATAGGCAGATGTGTTGCAAGAAT
CATCTTAGAAAGAAATGATATTGAGCTTGTGGCGATAAATGATACTACGGATATTGAACT
TACAAAATACCTTTTTAAATACGATACAGTACATGGTGAATTTAAAGGCAGTGTTGATAG
TGAAGGAGATGATTTAGTGGTAAATGGTAAAAAAATCAAAGTATTTAAAAGTCGCAATGT
AAAAGATCTTGACTTTGCAAAACACGGCGCACAAATTGTTTTAGAGTGCACAGGAGCGCA
TTTAACTATGGCAAAATGTCAAGAATTTATAGATATGGGAGTACAAAAAGTGATCATGAG
TGCTCCTGCAAAAGATGATACTCCTACTTATGTTTTAGGAGTAAATTCAGAACTTTACAA
GGGTGAAAGCATTATTTCTAATGCAAGTTGTACAACAAATTGTTTAGGTCCTGTTTGTCG
TGTTTTACAAGATAATTTTGGCATAGAAAAAGGACTTATGACAACAATACATGCTTATAC
AAATGGACAAAGTATTATTGATGCTAAAGCTAAAGATAAACGCCGTTCTCGTGCTGCAGC
GCAAAATATCATTCCAACTTCTACAGGCGCAGCAAAAGCTATGAAACTTGTTATGCCTGA
ACTTAATGGCAAGCTTCATGGACAAAGTATGCGTGTGCCAGTGATTGATGTATCAAGCGT
GGATTTAACTGCACAACTAAGCCGTAAAGTTAGCAAAGATGAAATCAATGAAGCTTTCAG
AAAAGCTGCAGCTACAAATTTAAAAGGCATTTTAATGGTAGATGATGATGAAAGAGTTTC
AAGCGATTTTATCACTTGTTCTTATGGAGCTATTGTAGCAAGTGATTTAACTCAAGTGAT
TGCGGATGATTTTATCAAGGTAATTGCTTGGTATGATAATGAATGGGGCTATTCAAGTCG
TCTAGTAGATATGGCAGTATATATTGCAAATAAGGCTTAATCATGAGTGATATTATTTCT
ATAAAAGACATTGATTTAGCTAAGAAAAAAGTTTTTATAAGATGTGATTTTAATGTGCCT
CAAGATGATTTTTTAAATATCACTGATGATAGACGCATAAGATCAGCTATTCCTACGATA
AGATATTGTCTGGATAATGGTTGTAGTGTGATTTTAGCCTCTCATTTACGGCGTCCAAA
Round #3
>C_jejuni - extended sequence - Contig1
TTAAAGAGTATATCGATAATCTCTAAAAATTAAAAAGACTAATAAATTTTAGCCTTTTTA
AACCCTACCTTTTTTAAGATTTTCTGGTAATTCTTCTATATTATAAATTCCTCTGTGTTC
TGGTGTTAAAAGATGGATTAAAATATCACCAAGATCAATCACGCTCCATTCTTCACTACT
ATCTATGTTTAAAAATTCCTCACCTTTGGCTTTAAGTCGTGTGTTAAGCTCATCGATCAA
AGATAGAGCGTGTCTTTCTCCTAAAGTAGCTGCAATAATGACATATTTTACAAAGTATTC
TTGCTCGCTCATGTCAATGGTTTTGATATTTTCAGCTTTTTTTTCATCTAAAATTTTAAC
GATTAAATCTATTCTTTCTTGCATTATTGTCCTTTAATTTTTGAAATTGTATCAATTTTT
TTGTAATTTTTCATAATATTTTTTTACTTCATCTTTAATTTCTTCACAAACCTCATTTGT
ATTTAAAGTGTCGCGTATGAAAGAAGAAGCGATTTTTTTATTGGTTTTTAAATCTTTGAA
ATTCTTAGGAATTCCTATATCATTGCGATTGGCAATAACAAATTCTACTAAAGAATTGAG
TTTTTCAAAATCATGCCAAAGATGAAGTTTTTCTAAATGATCTGCGCCAATTAAAAGATA
AAATTTACTAGGATTATAAAGCTTATAAAGATACTTAACACTTTCTATGCTAGGAACAGG
GCGTTTTTGCCTGATTTCAAAATCGCAAATTTCAACTTTTGGCAAATGTCCCCAAAGTTT
TTTAACCCATAAGAATCTTTGCTTTTCATCAGCACTAAAACTTTGTTTAAAAGGATTGAT
ATAAGTAGGCATAATAATAAGTTTATCAATATCTAATTTTTCCAAAGCCTCTAAAACAAC
GCTATTATGACCATTATGCGGTGGATCAAAACTGCCACCAAAAAGTGCTATCTTCATTAA
AATTTTAACCTTTTTTTGTAGAATATTAGCATTATATTTTGCAAAAGGAAATTAAATGGC
TGTAAAAGTAGCTATAAATGGTGTTGGACGCATAGGCAGATGTGTTGCAAGAATCATCTT
AGAAAGAAATGATATTGAGCTTGTGGCGATAAATGATACTACGGATATTGAACTTACAAA
ATACCTTTTTAAATACGATACAGTACATGGTGAATTTAAAGGCAGTGTTGATAGTGAAGG
AGATGATTTAGTGGTAAATGGTAAAAAAATCAAAGTATTTAAAAGTCGCAATGTAAAAGA
TCTTGACTTTGCAAAACACGGCGCACAAATTGTTTTAGAGTGCACAGGAGCGCATTTAAC
TATGGCAAAATGTCAAGAATTTATAGATATGGGAGTACAAAAAGTGATCATGAGTGCTCC
TGCAAAAGATGATACTCCTACTTATGTTTTAGGAGTAAATTCAGAACTTTACAAGGGTGA
AAGCATTATTTCTAATGCAAGTTGTACAACAAATTGTTTAGGTCCTGTTTGTCGTGTTTT
ACAAGATAATTTTGGCATAGAAAAAGGACTTATGACAACAATACATGCTTATACAAATGG
ACAAAGTATTATTGATGCTAAAGCTAAAGATAAACGCCGTTCTCGTGCTGCAGCGCAAAA
TATCATTCCAACTTCTACAGGCGCAGCAAAAGCTATGAAACTTGTTATGCCTGAACTTAA
TGGCAAGCTTCATGGACAAAGTATGCGTGTGCCAGTGATTGATGTATCAAGCGTGGATTT
AACTGCACAACTAAGCCGTAAAGTTAGCAAAGATGAAATCAATGAAGCTTTCAGAAAAGC
TGCAGCTACAAATTTAAAAGGCATTTTAATGGTAGATGATGATGAAAGAGTTTCAAGCGA
TTTTATCACTTGTTCTTATGGAGCTATTGTAGCAAGTGATTTAACTCAAGTGATTGCGGA
TGATTTTATCAAGGTAATTGCTTGGTATGATAATGAATAGGGCTATTCAAGTCGTCTAGT
AGATATGGCAGTATATATTGCAAATAAGGCTTAATCATGAGTGATATTATTTCTATAAAA
GACATTGATTTAGCTAAGAAAAAAGTTTTTATAAGATGTGATTTTAATGTTCCTCAAGAT
GATTTTTTAAATATCACTGATGATAGACGCATAAGATCAGCTATTCCTACGATAAGATAT
TGTTTGGATAATGGTTGTAGTGTGATTTTAGCCTCTCATTTAGGGCGTCCAAAAGAAATT
AGCTCTAAATATTCTTTAGAACCTGTGGCTAAGCGTCTTGCTAGACTTTTAGATAAAGAA
ATTGTTATGGCAAAAGATGTTATCGGCGAAGATGCAAAAACCAAAGCTATGAATTTAAAA
GCGGGTGAAATTTTACTTCTTGAAAATTTGCGTTTTGAAAAAGGCGAAACTAAAAATGAT
GAAAATTTAGCCAAAGAACTTGCTTCTATGGTTCAAGTTTATATCAATGATGCTTTTGGA
GTATGCCATAGAGCACATTCTAGTGTAGAGGCGATTACTAAATTTTTTGATGAAAAACAC
AAAGGCGCAGGATTTTTACTCCAAAAAGACATTGATTTTGCAAGCAATCTTATCAAACAT
CCAGCACGTCCTTTTGTCGCTGTTGTTGGAGGTTCAAAGGTAAGTGGAAAACTTCAAGCA
TTGACAAATTTATTACCAAAGGTAGATAAATTAATCATAGGCGGAGGTATGGCATTTACT
TTTTTAAAAGCTTTAGGTTATGATATAGGAAATTCANTTTTAGAAGAAGAACTTTTAGAA
GAAGCTAATAAAATTCTTACCAAGGGTAAAAATTTAGGAGTACCATTCCTCTT
Round #4
>C_jejuni - extended sequence - Contig1
TAGATTTAAGAGGTGATGAGATAATATTCCGCGATTGAATTTATTTTAAAAAGGAATTAA
AAATGAAAAAAATACTTATTCTACTTACACTATGTGCTTTAGATTTTGGTGCAAGTGAAT
GTGATAGAAAAATCGATCGTATCAATAAAGAAATCAGTTTTTCTAAAGCGCATAATGATA
CAGCTAGAACTTTAAGCTTAGAGCTTGCTTTAAAACAAGTACAAAATGATTGTGCTAAAG
ATCCTATGTTTTATGATAAAAAGTTAGAAGCTAAAAAACTTAAAGAACAAGAAGTGGAAA
AAATCGAAAAAGAACTTGATGCTTTAAAAGAACAAAAAGATTATATGAGCAAGGCTGAGT
ATAAAGCTAAAAAAGAAGCTTTAAAAGAACAAAAAGAGAAAATCAAAAAATAAATTAAAG
AATATATCGATAATCTCTAAAAATTAAAAAGACTAATAAATTTTAGCCTTTTTAAACCCT
ACCTTTTTTAAGATTTTCTAATAATTCTTCTATATTATAAATTCCTCTGTGTTCTGGTGT
TAAAAGATGGATTAAAATATCACCAAGATCAATCACGCTCCATTCTTCACTACTATCTAT
GTTTAAAAATTCCTCACCTTTGGCTTTAAGTCGTGTTTTAAGCTCATCGATCAAAGATAG
AGCGTGTCTTTCTCCTAAAGTAGCTGCAATAATGACATATTTTACAAAGTATTCTTGCTC
GCTCATGTCAATGGTTTTGATATTTTCAGCTTTTTTTTCATCTAAAATTTTAACGATTAA
ATCTATTCTTTCTTGCATTATTGTCCTTTAATTTTTGAAATTGTATCAATTTTTTTGTAA
TTTTTCATAATATTTTTTTACTTCATCTTTAATTTCTTCACAAACCTCATTTGTATTTAA
AGTGTCGCGTATGAAAGAAGAAGCGATTTTTTTATTGGTTTTTAAATCTTTGAAATTCTT
AGGAATTCCTATATCATTGCGATTGGCAATAACAAATTCTACTAAAGAATTGAGTTTTTC
AAAATCATGCCAAAGATGAAGTTTTTCTAAATGATCTGCGCCAATTAAAAGATAAAATTT
ACTAGGATTATAAAGCTTATAAAGATACTTAACACTTTCTATGCTAGGAACAGGGCGTTT
TTGCCTGATTTCAAAATCGCAAATTTCAACTTTTGGCAAATGTCCCCAAAGTTTTTTAAC
CCATAAGAATCTTTGCTTTTCATCAGCACTAAAACTTTGTTTAAAAGGATTGATATAAGT
AGGCATAATAATAAGTTTATCAATATCTAATTTTTCCAAAGCCTCTAAAACAACGCTATT
ATGACCATTATGCGGTGGATCAAAACTGCCACCAAAAAGTGCTATCTTCATTAAAATTTT
AACCTTTTTTTGTAGAATATTAGCATTATATTTTGCAAAAGGAAATTAAATGGCTGTAAA
AGTAGCTATAAATGGTGTTGGACGCATAGGCAGATGTGTTGCAAGAATCATCTTAGAAAG
AAATGATATTGAGCTTGTGGCGATAAATGATACTACGGATATTGAACTTACAAAATACCT
TTTTAAATACGATACAGTACATGGTGAATTTAAAGGCAGTGTTGATAGTGAAGGAGATGA
TTTAGTGGTAAATGGTAAAAAAATCAAAGTATTTAAAAGTCGCAATGTAAAAGATCTTGA
CTTTGCAAAACACGGCGCACAAATTGTTTTAGAGTGCACAGGAGCGCATTTAACTATGGC
AAAATGTCAAGAATTTATAGATATGGGAGTACAAAAAGTGATCATGAGTGCTCCTGCAAA
AGATGATACTCCTACTTATGTTTTAGGAGTAAATTCAGAACTTTACAAGGGTGAAAGCAT
TATTTCTAATGCAAGTTGTACAACAAATTGTTTAGGTCCTGTTTGTCGTGTTTTACAAGA
TAATTTTGGCATAGAAAAAGGACTTATGACAACAATACATGCTTATACAAATGGACAAAG
TATTATTGATGCTAAAGCTAAAGATAAACGCCGTTCTCGTGCTGCAGCGCAAAATATCAT
TCCAACTTCTACAGGCGCAGCAAAAGCTATGAAACTTGTTATGCCTGAACTTAATGGCAA
GCTTCATGGACAAAGTATGCGTGTGCCAGTGATTGATGTATCAAGCGTGGATTTAACTGC
ACAACTAAGCCGTAAAGTTAGCAAAGATGAAATCAATGAAGCTTTCAGAAAAGCTGCAGC
TACAAATTTAAAAGGCATTTTAATGGTAGATGATGATGAAAGAGTTTCAAGCGATTTTAT
CACTTGTTCTTATGGAGCTATTGTAGCAAGTGATTTAACTCAAGTGATTGCGGATGATTT
TATCAAGGTAATTGCTTGGTATGATAATGAATAGGGCTATTCAAGTCGTCTAGTAGATAT
GGCAGTATATATTGCAAATAAGGCTTAATCATGAGTGATATTATTTCTATAAAAGACATT
GATTTAGCTAAGAAAAAAGTTTTTATAAGATGTGATTTTAATGTTCCTCAAGATGATTTT
TTAAATATCACTGATGATAGACGCATAAGATCAGCTATTCCTACGATAAGATATTGTTTG
GATAATGGTTGTAGTGTGATTTTAGCCTCTCATTTAGGGCGTCCAAAAGAAATTAGCTCT
AAATATTCTTTAGAACCTGTGGCTAAGCGTCTTGCTAGACTTTTAGATAAAGAAATTGTT
ATGGCAAAAGATGTTATCGGCGAAGATGCAAAAACCAAAGCTATGAATTTAAAAGCGGGT
GAAATTTTACTTCTTGAAAATTTGCGTTTTGAAAAAGGCGAAACTAAAAATGATGAAAAT
TTAGCCAAAGAACTTGCTTCTATGGTTCAAGTTTATATCAATGATGCTTTTGGAGTATGC
CATAGAGCACATTCTAGTGTAGAGGCGATTACTAAATTTTTTGATGAAAAACACAAAGGC
GCAGGATTTTTACTCCAAAAAGAAATTGATTTTGCAAGCAATCTTATCAAACATCCAGCA
CGTCCTTTTGTCGCTGTTGTTGGAGGTTCAAAGGTAAGTGGAAAACTTCAAGCATTGACA
AATTTATTACCAAAGGTAGATAAATTAATCATAGGCGGAGGTATGGCATTTACTTTTTTA
AAAGCTTTAGGTTATGATATAGGAAATTCACTTTTAGAAGAAGAACTTTTAGAAGAAGCT
AATAAAATTCTTACCAAGGGTAAAAATTTAGGAGTGAAAATTTATCTTCCAGTAGATGTT
GTAGCCGCTCCTGCGTGCTCACAAGATGTGCCGATGAAATTTGTTCCAGCGCAAGAAATT
CCAAATGGTTGGATGGGTTTAGATATAGGACCTGCGAGTGTGAGACTTTTTAAGGAGGTG
ATTTCTGATGCGCAAACGATTTGGTGGAATGGACCTATGGGTGTTTTTGAAATTGATAAA
TTTTCAAAAGGTAGCATTAAAATGAGTCATTATATCAGCGAAGGACATGCAACTTCTGTT
GTTGGAGGCGGTGATACGGCTGATGTGGTTGCGCGTGCAGGTGATGCAGATGAAATGACT
TTTATTTCTACTGGAGGTGGTGCTTCTCTTGAACTTATAGAAGGCAAAGAACTTCCAGGT
GTAAAAGCTTTAAGATCTAAGGAAAATGAATGATCTTTGCTGCAAATTTAAAATGCAATC
ACACAAGAGCAAGCTTTAAAATTTATGCTCAAATTTTAAATAAAACTATGGCGGTAAAAT
GCGATGATATTATCGTTTTTCCACCTAGTATAGCAT
Round #5
>C_jejuni - extended sequence - Contig1
GCTGCTGAAGTGAGTGGGCATATTTTCTATAAACATAGATATTTTGGTTATGATGATGAA
TTTATGCATTTTTAAGAGCGTCGGAGCTTGTTTATAAAGTGTTTGATCTAGAAAGTATGA
TTAAAGCTTTACCAAAACTTTATACTACACCTGAAATTAAAATTCCTGTAAATGAAGAAG
AAAAATTCAAACTTGTGGAAGAATTTCAAAAAGAGATTGAAAAAGGAGCTTTAAAAGGTG
TTAAAAGTCTTTGTGAAATTGATGGAGCTAGGATAGATTTTGGCGATGGATGGGCTTTAC
TTCGTGCATCTAATACCAGCCCTTATCTTATCACACGCTTTGAGGCAACATCTTTAGAAA
GAGCAAAAGAGCTTGAAAGTATGGTATTTACTTTGTTTAATGATATAAAAGCTAGATTTA
AGAATTGATGAGATAATATTCCGCGATTTAATTTATTTTAAAAAGGAATTAAAAATGAAA
AAAATACTTATTCTACTTACACTATGTGCTTTTGCTTTTGGTGCAAGTGAATGTGATAGA
AAAATCGATCGTATCAATAAAGAAATCAGTTTTTCTAAAGCGCATAATGATACAGCTAGA
ACTTTAAGCTTAGAGCTTGCTTTAAAACAAGTACAAAATGATTGTGCTAAAGATCCTATG
TTTTATGATAAAAAGTTAGAAGCTAAAAAACTTAAAGAACAAGAAGTGGAAAAAATCGAA
AAAGAACTTGATGCTTTAAAAGAACAAAAAGATTATATGAGCAAGGCTGAGTATAAAGCT
AAAAAAGAAGCTTTAAAAGAACAAAAAGAGAAAATCAAAAAATAAATTAAAGAATATATC
GATAATCTCTAAAAATTAAAAAGACTAATAAATTTTAGCCTTTTTAAACCCTACCTTTTT
TAAGATTTTCTAATAATTCTTCTATATTATAAATTCCTCTGTGTTCTGGTGTTAAAAGAT
GGATTAAAATATCACCAAGATCAATCACGCTCCATTCTTCACTACTATCTATGTTTAAAA
ATTCCTCACCTTTGGCTTTAAGTCGTGTTTTAAGCTCATCGATCAAAGATAGAGCGTGTC
TTTCTCCTAAAGTAGCTGCAATAATGACATATTTTACAAAGTATTCTTGCTCGCTCATGT
CAATGGTTTTGATATTTTCAGCTTTTTTTTCATCTAAAATTTTAACGATTAAATCTATTC
TTTCTTGCATTATTGTCCTTTAATTTTTGAAATTGTATCAATTTTTTTGTAATTTTTCAT
AATATTTTTTTACTTCATCTTTAATTTCTTCACAAACCTCATTTGTATTTAAAGTGTCGC
GTATGAAAGAAGAAGCGATTTTTTTATTGGTTTTTAAATCTTTGAAATTCTTAGGAATTC
CTATATCATTGCGATTGGCAATAACAAATTCTACTAAAGAATTGAGTTTTTCAAAATCAT
GCCAAAGATGAAGTTTTTCTAAATGATCTGCGCCAATTAAAAGATAAAATTTACTAGGAT
TATAAAGCTTATAAAGATACTTAACACTTTCTATGCTAGGAACAGGGCGTTTTTGCCTGA
TTTCAAAATCGCAAATTTCAACTTTTGGCAAATGTCCCCAAAGTTTTTTAACCCATAAGA
ATCTTTGCTTTTCATCAGCACTAAAACTTTGTTTAAAAGGATTGATATAAGTAGGCATAA
TAATAAGTTTATCAATATCTAATTTTTCCAAAGCCTCTAAAACAACGCTATTATGACCAT
TATGCGGTGGATCAAAACTGCCACCAAAAAGTGCTATCTTCATTAAAATTTTAACCTTTT
TTTGTAGAATATTAGCATTATATTTTGCAAAAGGAAATTAAATGGCTGTAAAAGTAGCTA
TAAATGGTGTTGGACGCATAGGCAGATGTGTTGCAAGAATCATCTTAGAAAGAAATGATA
TTGAGCTTGTGGCGATAAATGATACTACGGATATTGAACTTACAAAATACCTTTTTAAAT
ACGATACAGTACATGGTGAATTTAAAGGCAGTGTTGATAGTGAAGGAGATGATTTAGTGG
TAAATGGTAAAAAAATCAAAGTATTTAAAAGTCGCAATGTAAAAGATCTTGACTTTGCAA
AACACGGCGCACAAATTGTTTTAGAGTGCACAGGAGCGCATTTAACTATGGCAAAATGTC
AAGAATTTATAGATATGGGAGTACAAAAAGTGATCATGAGTGCTCCTGCAAAAGATGATA
CTCCTACTTATGTTTTAGGAGTAAATTCAGAACTTTACAAGGGTGAAAGCATTATTTCTA
ATGCAAGTTGTACAACAAATTGTTTAGGTCCTGTTTGTCGTGTTTTACAAGATAATTTTG
GCATAGAAAAAGGACTTATGACAACAATACATGCTTATACAAATGGACAAAGTATTATTG
ATGCTAAAGCTAAAGATAAACGCCGTTCTCGTGCTGCAGCGCAAAATATCATTCCAACTT
CTACAGGCGCAGCAAAAGCTATGAAACTTGTTATGCCTGAACTTAATGGCAAGCTTCATG
GACAAAGTATGCGTGTGCCAGTGATTGATGTATCAAGCGTGGATTTAACTGCACAACTAA
GCCGTAAAGTTAGCAAAGATGAAATCAATGAAGCTTTCAGAAAAGCTGCAGCTACAAATT
TAAAAGGCATTTTAATGGTAGATGATGATGAAAGAGTTTCAAGCGATTTTATCACTTGTT
CTTATGGAGCTATTGTAGCAAGTGATTTAACTCAAGTGATTGCGGATGATTTTATCAAGG
TAATTGCTTGGTATGATAATGAATAGGGCTATTCAAGTCGTCTAGTAGATATGGCAGTAT
ATATTGCAAATAAGGCTTAATCATGAGTGATATTATTTCTATAAAAGACATTGATTTAGC
TAAGAAAAAAGTTTTTATAAGATGTGATTTTAATGTTCCTCAAGATGATTTTTTAAATAT
CACTGATGATAGACGCATAAGATCAGCTATTCCTACGATAAGATATTGTTTGGATAATGG
TTGTAGTGTGATTTTAGCCTCTCATTTAGGGCGTCCAAAAGAAATTAGCTCTAAATATTC
TTTAGAACCTGTGGCTAAGCGTCTTGCTAGACTTTTAGATAAAGAAATTGTTATGGCAAA
AGATGTTATCGGCGAAGATGCAAAAACCAAAGCTATGAATTTAAAAGCGGGTGAAATTTT
ACTTCTTGAAAATTTGCGTTTTGAAAAAGGCGAAACTAAAAATGATGAAAATTTAGCCAA
AGAACTTGCTTCTATGGTTCAAGTTTATATCAATGATGCTTTTGGAGTATGCCATAGAGC
ACATTCTAGTGTAGAGGCGATTACTAAATTTTTTGATGAAAAACACAAAGGCGCAGGATT
TTTACTCCAAAAAGAAATTGATTTTGCAAGCAATCTTATCAAACATCCAGCACGTCCTTT
TGTCGCTGTTGTTGGAGGTTCAAAGGTAAGTGGAAAACTTCAAGCATTGACAAATTTATT
ACCAAAGGTAGATAAATTAATCATAGGCGGAGGTATGGCATTTACTTTTTTAAAAGCTTT
AGGTTATGATATAGGAAATTCACTTTTAGAAGAAGAACTTTTAGAAGAAGCTAATAAAAT
TCTTACCAAGGGTAAAAATTTAGGAGTGAAAATTTATCTTCCAGTAGATGTTGTAGCCGC
TCCTGCGTGCTCACAAGATGTGCCGATGAAATTTGTTCCAGCGCAAGACATTCCAAATGG
TTGGATGGGTTTAGATATAGGACCTGCGAGTGTGAGACTTTTTAAGGAGGTGATTTCTGA
TGCGCAAACGATTTGGTGGAATGGACCTATGGGTGTTTTTGAAATTGATAAATTTTCAAA
AGGTAGCATTAAAATGAGTCATTATATCAGCGAAGGACATGCAACTTCTGTTGTTGGAGG
CGGTGATACGGCTGATGTGGTTGCGCGTGCAGGTGATGCAGATGAAATGACTTTTATTTC
TACTGGAGGTGGTGCTTCTCTTGAACTTATAGAAGGCAAAGAACTTCCAGGTGTAAAAGC
TTTAAGATCTAAGGAAAATGAATGATCTTTGCTGCAAATTTAAAATGCAATCACACAAGA
GCAAGCTTTAAAATTTATGCTAAAATTTTAAATAAAACTATGGGGGTAAAATGCGATGAT
ATTATCGTTTTTCCACCTAGTATAGCATTTTTAGAAAATGAAAATAACTTCATACAAGGA
GCGCAAAATTTTTATCCTTGTGTTAATGGTGCTTTTACAGGCGAGCTTGGAAAAGAACAT
TTGGACGAATTTGGGATTAAATGTGTCTTAATCGGGCATTCTGAAAGAAGAGCTTTAGGA
GATGAAGAATTTATTAAGGCTAAATTTGATTTTGCTAAAGAGCATGGTTATAAAATTGTT
TTTTGTATAGGTGAAAATTTAGATACAAAAAATTCAGGCAAGACTTTAGAGTTTTTAAAA
AAACAACTTGAAATTATTGATTTAAATTATGAAAAACTCATCATCGCTTATGAGCCTATT
TATTCTATAGGAACGGGAGTGAGCGCACAAAGTACAGATATCGCTAAAGTGCTTGAATTT
TTAGCGAGTTTAACCAAAGTACCTTTGCTTTATGGTGGAAGTGTGAATGAAAATAATATC
AAAGAAATTTTAAGTGTAAATCATTGTGGTGGAGTTTTGATAGGCTCTGCAGCTTTAAAA
GTAGAAAATTTTATAAAATTAATCAAAGGATAAAAGATGATTATGAAGGGTAAAAAAGGC
CTTATTGTAGGGGTTGCAAATAATAAATCTATTGCTTATGGCATAGCAAAAGCATGTTTT
GATCAAGGAGCCGAGCTTGCTTTTACTTTTTTAAATGATGGTTTTAAAAAACGCGTAGAA
CCTATAGCACCAGAGTTTAATTCTAATTTTGTTTATGAGCTTGATGTAAATAATCACGCG
CATTTAGA
FINAL CONTIG(S)
>C_jejuni - final extended sequence - Contig1
GCTGCTGAAGTGAGTGGGCATATTTTCTATAAACATAGATATTTTGGTTATGATGATGAA
TTTATGCATTTTTAAGAGCGTCGGAGCTTGTTTATAAAGTGTTTGATCTAGAAAGTATGA
TTAAAGCTTTACCAAAACTTTATACTACACCTGAAATTAAAATTCCTGTAAATGAAGAAG
AAAAATTCAAACTTGTGGAAGAATTTCAAAAAGAGATTGAAAAAGGAGCTTTAAAAGGTG
TTAAAAGTCTTTGTGAAATTGATGGAGCTAGGATAGATTTTGGCGATGGATGGGCTTTAC
TTCGTGCATCTAATACCAGCCCTTATCTTATCACACGCTTTGAGGCAACATCTTTAGAAA
GAGCAAAAGAGCTTGAAAGTATGGTATTTACTTTGTTTAATGATATAAAAGCTAGATTTA
AGAATTGATGAGATAATATTCCGCGATTTAATTTATTTTAAAAAGGAATTAAAAATGAAA
AAAATACTTATTCTACTTACACTATGTGCTTTTGCTTTTGGTGCAAGTGAATGTGATAGA
AAAATCGATCGTATCAATAAAGAAATCAGTTTTTCTAAAGCGCATAATGATACAGCTAGA
ACTTTAAGCTTAGAGCTTGCTTTAAAACAAGTACAAAATGATTGTGCTAAAGATCCTATG
TTTTATGATAAAAAGTTAGAAGCTAAAAAACTTAAAGAACAAGAAGTGGAAAAAATCGAA
AAAGAACTTGATGCTTTAAAAGAACAAAAAGATTATATGAGCAAGGCTGAGTATAAAGCT
AAAAAAGAAGCTTTAAAAGAACAAAAAGAGAAAATCAAAAAATAAATTAAAGAATATATC
GATAATCTCTAAAAATTAAAAAGACTAATAAATTTTAGCCTTTTTAAACCCTACCTTTTT
TAAGATTTTCTAATAATTCTTCTATATTATAAATTCCTCTGTGTTCTGGTGTTAAAAGAT
GGATTAAAATATCACCAAGATCAATCACGCTCCATTCTTCACTACTATCTATGTTTAAAA
ATTCCTCACCTTTGGCTTTAAGTCGTGTTTTAAGCTCATCGATCAAAGATAGAGCGTGTC
TTTCTCCTAAAGTAGCTGCAATAATGACATATTTTACAAAGTATTCTTGCTCGCTCATGT
CAATGGTTTTGATATTTTCAGCTTTTTTTTCATCTAAAATTTTAACGATTAAATCTATTC
TTTCTTGCATTATTGTCCTTTAATTTTTGAAATTGTATCAATTTTTTTGTAATTTTTCAT
AATATTTTTTTACTTCATCTTTAATTTCTTCACAAACCTCATTTGTATTTAAAGTGTCGC
GTATGAAAGAAGAAGCGATTTTTTTATTGGTTTTTAAATCTTTGAAATTCTTAGGAATTC
CTATATCATTGCGATTGGCAATAACAAATTCTACTAAAGAATTGAGTTTTTCAAAATCAT
GCCAAAGATGAAGTTTTTCTAAATGATCTGCGCCAATTAAAAGATAAAATTTACTAGGAT
TATAAAGCTTATAAAGATACTTAACACTTTCTATGCTAGGAACAGGGCGTTTTTGCCTGA
TTTCAAAATCGCAAATTTCAACTTTTGGCAAATGTCCCCAAAGTTTTTTAACCCATAAGA
ATCTTTGCTTTTCATCAGCACTAAAACTTTGTTTAAAAGGATTGATATAAGTAGGCATAA
TAATAAGTTTATCAATATCTAATTTTTCCAAAGCCTCTAAAACAACGCTATTATGACCAT
TATGCGGTGGATCAAAACTGCCACCAAAAAGTGCTATCTTCATTAAAATTTTAACCTTTT
TTTGTAGAATATTAGCATTATATTTTGCAAAAGGAAATTAAATGGCTGTAAAAGTTGCTA
TAAATGGTTTTGGACGCATAGGCAGATGTGTTGCAAGAATCATCTTAGAAAGAAATGATA
TTGAGCTTGTGGCGATAAATGATACTACGGATATTGAACTTACAAAATACCTTTTTAAAT
ACGATACAGTACATGGTGAATTTAAAGGCAGTGTTGATAGTGAAGGAGATGATTTAGTGG
TAAATGGTAAAAAAATCAAAGTATTTAAAAGTCGCAATGTAAAAGATCTTGACTTTGCAA
AACACGGCGCACAAATTGTTTTAGAGTGCACAGGAGCGCATTTAACTATGGCAAAATGTC
AAGAATTTATAGATATGGGAGTACAAAAAGTGATCATGAGTGCTCCTGCAAAAGATGATA
CTCCTACTTATGTTTTAGGAGTAAATTCAGAACTTTACAAGGGTGAAAGCATTATTTCTA
ATGCAAGTTGTACAACAAATTGTTTAGGTCCTGTTTGTCGTGTTTTACAAGATAATTTTG
GCATAGAAAAAGGACTTATGACAACAATACATGCTTATACAAATGGACAAAGTATTATTG
ATGCTAAAGCTAAAGATAAACGCCGTTCTCGTGCTGCAGCGCAAAATATCATTCCAACTT
CTACAGGCGCAGCAAAAGCTATGAAACTTGTTATGCCTGAACTTAATGGCAAGCTTCATG
GACAAAGTATGCGTGTGCCAGTGATTGATGTATCAAGCGTGGATTTAACTGCACAACTAA
GCCGTAAAGTTAGCAAAGATGAAATCAATGAAGCTTTCAGAAAAGCTGCAGCTACAAATT
TAAAAGGCATTTTAATGGTAGATGATGATGAAAGAGTTTCAAGCGATTTTATCACTTGTT
CTTATGGAGCTATTGTAGCAAGTGATTTAACTCAAGTGATTGCGGATGATTTTATCAAGG
TAATTGCTTGGTATGATAATGAATGGGGCTATTCAAGTCGTCTAGTAGATATGGCAGTAT
ATATTGCAAATAAGGCTTAATCATGAGTGATATTATTTCTATAAAAGACATTGATTTAGC
TAAGAAAAAAGTTTTTATAAGATGTGATTTTAATGTTCCTCAAGATGATTTTTTAAATAT
CACTGATGATAGACGCATAAGATCAGCTATTCCTACGATAAGATATTGTTTGGATAATGG
TTGTAGTGTGATTTTAGCCTCTCATTTAGGGCGTCCAAAAGAAATTAGCTCTAAATATTC
TTTAGAACCTGTGGCTAAGCGTCTTGCTAGACTTTTAGATAAAGAAATTGTTATGGCAAA
AGATGTTATCGGCGAAGATGCAAAAACCAAAGCTATGAATTTAAAAGCGGGTGAAATTTT
ACTTCTTGAAAATTTGCGTTTTGAAAAAGGCGAAACTAAAAATGATGAAAATTTAGCCAA
AGAACTTGCTTCTATGGTTCAAGTTTATATCAATGATGCTTTTGGAGTATGCCATAGAGC
ACATTCTAGTGTAGAGGCGATTACTAAATTTTTTGATGAAAAACACAAAGGCGCAGGATT
TTTACTCCAAAAAGAAATTGATTTTGCAAGCAATCTTATCAAACATCCAGCACGTCCTTT
TGTCGCTGTTGTTGGAGGTTCAAAGGTAAGTGGAAAACTTCAAGCATTGACAAATTTATT
ACCAAAGGTAGATAAATTAATCATAGGCGGAGGTATGGCATTTACTTTTTTAAAAGCTTT
AGGTTATGATATAGGAAATTCACTTTTAGAAGAAGAACTTTTAGAAGAAGCTAATAAAAT
TCTTACCAAGGGTAAAAATTTAGGAGTGAAAATTTATCTTCCAGTAGATGTTGTAGCCGC
TCCTGCGTGCTCACAAGATGTGCCGATGAAATTTGTTCCAGCGCAAGAAATTCCAAATGG
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